Kommensale Mikroorganismen leben mit uns zusammen, ohne uns zu schaden, häufig zum gegenseitigen Nutzen. Opportunistische Mikroorganismen sind normalerweise harmlos, können aber Probleme verursachen, wenn das Ökosystem aus dem Gleichgewicht gerät oder die Abwehr geschwächt ist. Pathogene können Krankheiten verursachen, wobei ihr Nachweis nicht immer bedeutet, dass eine Infektion vorliegt.
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