O stress não fica apenas na cabeça: chega ao intestino através do eixo intestino-cérebro. Quando é crónico, ativa a libertação de cortisol e de outras hormonas que modificam o movimento intestinal, a produção de muco protetor e, segundo estudos em animais e alguns em seres humanos, a permeabilidade da barreira intestinal. Estas alterações modificam o ambiente em que vivem as bactérias e podem favorecer espécies oportunistas em detrimento das benéficas.
A relação funciona nos dois sentidos, pelo que dormir bem, praticar exercício e utilizar técnicas de relaxamento beneficia tanto a mente como o microbioma. O relatório do eixo intestino-cérebro mostra-te o potencial do microbioma para produzir compostos como o GABA ou os derivados do triptofano; não mede o teu nível de stress nem de ansiedade.