Díky masivně paralelnímu sekvenování jsou analýzy mikrobiomu mnohem přesnější než před několika lety. Spolehlivost Vivabioma stojí na třech pilířích:
- Stabilizace vzorku. Kit obsahuje stabilizační kapalinu, která chrání mikrobiální DNA od okamžiku odběru vzorku až do jeho doručení do laboratoře.
- Technologie. Shotgun metagenomika analyzuje fragmenty veškeré mikrobiální DNA a vyhýbá se cílené amplifikaci jediného genu, jako je 16S. Přestože má i ona svá omezení a zkreslení, umožňuje identifikovat většinu mikroorganismů na úrovni druhu.
- Kontroly kvality v každé fázi, od extrakce DNA až po bioinformatickou analýzu.
Přesto je dobré znát jejich limity. Váš mikrobiom se v čase mění, takže výsledek je snímkem okamžiku odběru. Zastoupení mikroorganismů je relativní, referenční databáze neznají všechny mikroorganismy a detekce DNA mikroorganismu neprokazuje, že je živý nebo aktivní.
Přesnost identifikace mikroorganismů nebo genů je něco jiného než klinická užitečnost indexů, které se z nich vypočítávají: výsledek sám o sobě neumožňuje diagnostikovat onemocnění ani zvolit léčbu. Důkazy o rutinním klinickém využití testů mikrobiomu jsou zatím omezené, jak uvádí mezinárodní konsenzus o testování mikrobiomu v klinické praxi.