La dysbiose se produit lorsque l'équilibre entre les bactéries bénéfiques et opportunistes est rompu. Les causes les plus courantes dans le monde moderne sont :
- Régime occidental : Riche en sucres raffinés, en graisses saturées et en aliments ultra-transformés, mais pauvre en fibres.
- Excès d'hygiène et de désinfectants : Nous vivons dans des environnements "trop propres" qui nous privent de l'exposition aux microbes naturels.
- Médicaments récurrents : Non seulement les antibiotiques, mais aussi l'utilisation chronique d'anti-inflammatoires (AINS) ou de protecteurs gastriques.
- Toxines environnementales : Pesticides, additifs alimentaires et pollution.
- Manque de repos : L'altération du sommeil modifie la composition microbienne presque immédiatement.