Dysbiose treedt op wanneer de balans tussen nuttige en opportunistische bacteriën wordt verbroken. De meest voorkomende oorzaken in de moderne wereld zijn:
- Westers dieet: Rijk aan geraffineerde suikers, verzadigde vetten en ultrabewerkte voedingsmiddelen, maar arm aan vezels.
- Overmatige hygiëne en ontsmettingsmiddelen: We leven in "te schone" omgevingen die ons beroven van blootstelling aan natuurlijke microben.
- Terugkerende medicijnen: Niet alleen antibiotica, maar ook het chronische gebruik van ontstekingsremmers (NSAID's) of maagbeschermers.
- Milieutoxines: Pesticiden, levensmiddelenadditieven en vervuiling.
- Gebrek aan rust: Slaapverstoring verandert de microbiële samenstelling bijna onmiddellijk.