Разница колоссальна с точки зрения разрешения и глубины данных.
- Метод 16S (Традиционный): Может обнаруживать только бактерии и археи путем секвенирования небольшого участка определенного гена. Он дает общее представление (род), но не говорит точно, что делает каждый инструмент.
- Метагеномика Shotgun (Vivabioma): Случайным образом секвенирует все гены всех присутствующих организмов. Это позволяет нам обнаруживать не только бактерии, но и грибы, вирусы, археи и паразитов.
Кроме того, Shotgun позволяет нам проводить функциональные исследования: мы можем видеть, есть ли в вашей экосистеме гены, необходимые для выработки нейротрансмиттеров (таких как ГАМК), необходимых витаминов или защитных метаболитов. По сути, это разница между тем, чтобы знать, что в офисе есть люди (16S), и точно знать, какую работу выполняет каждый сотрудник (Shotgun).