Разнообразие отражает количество разных видов (видовое богатство) и равномерность их представленности (выравненность). В целом более разнообразный микробиом связан с более стабильной и устойчивой экосистемой, которая лучше восстанавливается после таких воздействий, как курс антибиотиков. Низкое разнообразие чаще наблюдается после антибиотиков, при питании с низким содержанием клетчатки и при некоторых заболеваниях.
Это взаимосвязь, а не диагноз: у здоровых людей тоже может быть умеренное разнообразие. Полезнее всего оценивать своё положение относительно референсной популяции и наблюдать за изменениями после смены привычек.