Skillnaden är enorm när det gäller upplösning och datadjup.
- 16S-metoden (Traditionell): Kan bara upptäcka bakterier och arkéer genom att sekvensera en liten region av en specifik gen. Den ger dig en allmän uppfattning (släktet), men den talar inte om exakt vad varje verktyg gör.
- Shotgun-metagenomik (Vivabioma): Sekvenserar slumpmässigt alla gener från alla närvarande organismer. Detta gör att vi kan upptäcka inte bara bakterier, utan även svampar, virus, arkéer och parasiter.
Dessutom gör Shotgun det möjligt för oss att utföra funktionella studier: vi kan se om ditt ekosystem har de nödvändiga generna för att producera signalsubstanser (som GABA), viktiga vitaminer eller skyddande metaboliter. Det är i huvudsak skillnaden mellan att veta att det finns människor på ett kontor (16S) och att veta exakt vilket arbete varje anställd utför (Shotgun).