È il formato standard per memorizzare le letture di sequenziamento: brevi sequenze di lettere (A, C, G e T), con un punteggio di qualità per ogni lettera. Ti forniamo le letture del campione in formato FASTQ dopo aver filtrato quelle umane, quindi il file contiene decine di milioni di letture, soprattutto di DNA microbico. Non include alcuna interpretazione.
È il formato più completo: tu o un bioinformatico potete rianalizzare i dati con altri strumenti o banche dati di riferimento, oggi o in futuro. Occupa diversi gigabyte, quindi per utilizzarlo servono software bioinformatici e un computer con capacità sufficienti. Se viene analizzato da un’altra azienda o piattaforma, i risultati possono essere diversi dai nostri e sono soggetti alle sue condizioni sulla privacy.