Forskjellen er enorm når det gjelder oppløsning og datadybde.
- 16S-metoden (Tradisjonell): Kan bare oppdage bakterier og arkebakterier ved å sekvensere en liten region av et spesifikt gen. Den gir deg en generell idé (slekten), men den forteller deg ikke nøyaktig hva hvert verktøy gjør.
- Shotgun Metagenomikk (Vivabioma): Sekvenserer tilfeldig alle genene til alle tilstedeværende organismer. Dette gjør at vi kan oppdage ikke bare bakterier, men også sopp, virus, arkebakterier og parasitter.
I tillegg lar Shotgun oss utføre funksjonelle studier: vi kan se om økosystemet ditt har de nødvendige genene for å produsere nevrotransmittere (som GABA), essensielle vitaminer eller beskyttende metabolitter. Det er i hovedsak forskjellen mellom å vite at det er folk på et kontor (16S) og å vite nøyaktig hvilken jobb hver ansatt gjør (Shotgun).