To zbiór genów bakteryjnych umożliwiających metabolizowanie estrogenów. Wątroba modyfikuje estrogeny, aby usunąć je z żółcią, ale niektóre bakterie jelitowe mają enzymy, takie jak beta-glukuronidaza, które ponownie je aktywują i umożliwiają ich wchłonięcie. Ta równowaga może wpływać na poziom estrogenów w organizmie zarówno u kobiet, jak i u mężczyzn. Badania wskazują na związki z menopauzą i innymi stanami hormonalnymi, ale ich wyniki są jeszcze wstępne.
Raport dotyczący profilu hormonalnego mikrobiomu w teście Advanced ocenia potencjał genetyczny mikrobiomu w tym procesie. Nie mierzy poziomu hormonów ani nie diagnozuje zaburzeń hormonalnych.