Dysbioza występuje, gdy równowaga między korzystnymi i oportunistycznymi bakteriami zostaje zaburzona. Najczęstsze przyczyny we współczesnym świecie to:
- Dieta zachodnia: Bogata w rafinowane cukry, tłuszcze nasycone i wysoko przetworzoną żywność, ale uboga w błonnik.
- Nadmiar higieny i środków dezynfekujących: Żyjemy w "zbyt czystych" środowiskach, które pozbawiają nas kontaktu z naturalnymi mikrobami.
- Nawracające leki: Nie tylko antybiotyki, ale także przewlekłe stosowanie leków przeciwzapalnych (NLPZ) lub leków osłonowych na żołądek.
- Toksyny środowiskowe: Pestycydy, dodatki do żywności i zanieczyszczenia.
- Brak odpoczynku: Zaburzenia snu zmieniają skład mikrobiologiczny prawie natychmiast.